Structure of a trypanosomatid mitochondrial cytochrome c with heme attached via only one thioether bond and implications for the substrate recognition requirements of heme lyase

Structure of a Trypanosomatid Mitochondrial Cytochrome c With Heme Attached Via Only One Thioether Bond and Implications for the Substrate Recognition Requirements of Heme Lyase

Tác giả: Vilmos Fülöp, Katharine A. Sam, Stuart J. Ferguson, Michael L. Ginger, James W. A. Allen

Lĩnh vực: Hóa sinh, Cấu trúc protein

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể tia X với độ phân giải 1.55 Å của cytochrome c ty thể từ sinh vật đơn bào Crithidia fasciculata. Điểm độc đáo của loại cytochrome c này, thuộc về nhóm Euglenozoa, là việc gắn heme vào protein thông qua chỉ một liên kết thioether duy nhất, khác với hai liên kết thioether thường thấy ở các cytochrome c ty thể khác. Dù có sự khác biệt cơ bản trong cách gắn heme và bộ máy sinh tổng hợp cytochrome c, cấu trúc của C. fasciculata cytochrome c cho thấy sự tương đồng đáng kể với các cytochrome c ty thể điển hình ở cả nếp gấp tổng thể và chi tiết gắn heme, bao gồm cả lập thể của liên kết heme-protein. Cấu trúc này cung cấp cái nhìn sâu sắc về quá trình chín muồi của cytochrome loại c ở Euglenozoa, đồng thời gợi ý về một môi trường redox đặc trưng trong khoang gian bào ty thể của các loài trùng roi. Kết quả cũng chỉ ra rằng enzyme heme lyase của nấm men Saccharomyces cerevisiae không thể chín muồi hiệu quả cytochrome c của Trypanosoma brucei hoặc một biến thể CXXCH khi biểu hiện trong tế bào chất của Escherichia coli, ngay cả khi có sự tương đồng cấu trúc lớn, cho thấy enzyme heme lyase có thể yêu cầu các đặc điểm nhận dạng cụ thể trên apo-cytochrome.

Mục lục chi tiết:

• Giới thiệu
• Cấu trúc của Crithidia fasciculata mitochondrial cytochrome c
• Hô hấp phụ thuộc cytochrome ở C. fasciculata
• Chi tiết về gắn heme trong C. fasciculata cytochrome c
• Quá trình chín muồi cytochrome c của trypanosome bởi heme lyase của nấm men
• Euglenozoan cytochrome c – tiến hóa và quá trình chín muồi
• Quá trình chín muồi cytochrome c bởi các hệ thống sinh tổng hợp khác
• Quy trình thực nghiệm
• Tinh sạch cytochrome c
• Kết tinh, xác định cấu trúc và tinh chỉnh mô hình
• Thống kê thu thập dữ liệu và tinh chỉnh
• Thử nghiệm chín muồi heme lyase của T. brucei cytochrome c
• Tài liệu tham khảo