Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 15 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

Structural insight into the evolutionary and pharmacologic homology of glutamate carboxypeptidases II and III

Tác giả: Klara Hlouchova, Cyril Barinka, Jan Konvalinka, Jacek Lubkowski

Lĩnh vực: Sinh hóa, Khoa học phân tử, Sinh học cấu trúc

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này trình bày phân tích cấu trúc toàn diện của bốn phức hợp chức năng của thụ thể glutamate carboxypeptidase III tái tổ hợp ở người (rhGCPIII), được giải quyết và tinh chỉnh ở độ phân giải cao. Các cấu trúc bao gồm rhGCPIII ở trạng thái ‘pseudo-unliganded’ và phức hợp với L-glutamate (sản phẩm thủy phân), một chất tương tự trạng thái chuyển tiếp phosphapeptide (EPE), và axit quisqualic (một chất đồng hình glutamate). Dữ liệu này làm sáng tỏ cấu trúc tổng thể và cách sắp xếp bậc bốn của phân tử rhGCPIII, định nghĩa kiến trúc của khoang liên kết cơ chất của rhGCPIII, và cung cấp bằng chứng thực nghiệm về sự hiện diện của các ion Zn2+ trong vị trí hoạt động song kim. Hơn nữa, các cấu trúc cho phép chi tiết hóa sự tương tác giữa enzyme và các phối tử của nó, đồng thời đặc trưng hóa tính linh hoạt chức năng của rhGCPIII, yếu tố cần thiết cho việc nhận diện cơ chất. So sánh các cấu trúc rhGCPIII này với các phức hợp GCPII tương đương cho thấy sự khác biệt trong việc tổ chức các túi đặc hiệu, sự phân bố điện tích bề mặt và sự chiếm chỗ của các vị trí kẽm đồng xúc tác. Thông tin được trình bày cung cấp một nền tảng quan trọng cho việc thiết kế dựa trên cấu trúc các chất ức chế đặc hiệu GCPIII và có thể là hướng dẫn cho các nghiên cứu so sánh GCPII/GCPIII trong tương lai.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả
    • Cấu trúc tổng thể, giao diện nhị phân và các vị trí N-glycosyl hóa
    • Trung tâm kim loại song binuclear
  • Thảo luận
  • Các thủ tục thực nghiệm
    • Biểu hiện và tinh chế rhGCPIII và rhGCPII
    • Chất ức chế
    • Thu thập và xử lý dữ liệu kết tinh
    • Quét huỳnh quang tia X và bản đồ dị thường
    • Xác định hằng số ức chế
  • Lời cảm ơn
  • Tài liệu tham khảo
  • Thông tin hỗ trợ