Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: 276 KB

Giới thiệu nội dung

Solution Structure of 2′,5′ d(G4C4): Relevance to Topological Restrictions and Nature’s Choice of Phosphodiester Links

Tác giả: Bernard J. Premraj, Swaminathan Raja, Neel S. Bhavesh, Ke Shi, Ramakrishna V. Hosur, Muttaiya Sundaralingam, and Narayanarao Yathindra

Lĩnh vực: Crystallography and Biophysics, Chemical Sciences, Chemistry

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc NMR của 2′,5′ d(GGGGCCCC) nhằm tìm hiểu sự khác biệt về cấu trúc giữa các dạng DNA liên kết 2′,5′ và 3′,5′, có thể liên quan đến sự lựa chọn liên kết đường-phosphate của tự nhiên để mã hóa thông tin di truyền. Oligomer này tạo thành cấu trúc xoắn kép với các gốc nucleotide mở rộng, chủ yếu mang cấu hình đường N-pucker. Các cặp bazơ trong xoắn kép thể hiện sự trượt (slide) và dịch chuyển theo trục X (X-displacement) tương tự như ADNA. Tuy nhiên, cấu trúc xoắn kép của iso d(GGGGCCCC) được đặc trưng bởi sự kết hợp của cả hai dạng A-DNA và B-DNA, chứ không hoàn toàn thuộc về một dạng nào. Kết quả này nhấn mạnh rằng DNA 2′,5′ chỉ hỗ trợ hình thành xoắn kép khi có sự trượt và dịch chuyển theo trục X đáng kể, khác với BDNA lý tưởng. Những hạn chế này được cho là có thể đã đóng vai trò trong việc tự nhiên ưu tiên liên kết 3′,5′ thay vì 2′,5′.

Mục lục chi tiết:

  • Introduction
  • Materials and methods
  • DNA synthesis and NMR sample preparation
  • NMR data acquisition
  • Experimental restraints
  • Structure calculation
  • Results
  • 1D and 2D proton spectra
  • Structure calculation
  • Discussion
  • Conclusions
  • Acknowledgements
  • References