Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 13 trang
Dung lượng: 254 KB

Giới thiệu nội dung

On The Mechanisms Of Glycolytic Oscillations In Yeast

Tác giả: Mads F. Madsen, Sune Danø, Preben G. Sørensen

Lĩnh vực: Sinh hóa, Động lực học hệ thống

Nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này khám phá cơ chế dẫn đến dao động đường phân trong nấm men. Các nhà nghiên cứu đã phân tích dữ liệu thực nghiệm và các mô hình trong hai trường hợp riêng biệt: dao động giống như giảm chấn trong chiết xuất nấm men, và dao động hình sin Hopf trong tế bào nấm men nguyên vẹn. Đối với chiết xuất nấm men, các dao động được xác định là do sự bật/tắt của phosphofructokinase. Trong trường hợp tế bào nấm men nguyên vẹn, sự bất ổn định dẫn đến dao động là do sự cân bằng tỉ lượng của hệ thống ATP-ADP-AMP và sự điều hòa allosteric của phosphofructokinase. Tỷ lệ NAD+/NADH điều biến tần số dao động mà không ảnh hưởng đến sự bất ổn định. Điều này quan trọng để hiểu sự đồng bộ hóa dao động giữa các tế bào nấm men, được cho là xảy ra thông qua acetaldehyde, yếu tố ảnh hưởng đến tần số dao động bằng cách thay đổi tỷ lệ này.

Mục lục chi tiết:

  • Keywords
  • Correspondence
  • Abstract
  • Autonomous oscillations in the concentrations of glycolytic intermediates
  • Dynamic properties of glycolytic oscillations
  • Proposed mechanisms of glycolytic oscillations
  • PFK kinetics
  • Distributed control
  • Hexose transport
  • Autocatalytic stoichiometry of ATP
  • Results
  • Intact yeast cells: Hopf dynamics
  • Phase plane analysis of experimental data
  • Analysis of a model describing oscillations in intact cells
  • Yeast extracts: Relaxation dynamics
  • Estimation of flux changes from experimental data
  • Comparison with the nine-variable model by Wolf et al.
  • Comparison with the extract model by Nielsen et al.
  • Discussion
  • The mechanism of glycolytic oscillations in intact yeast cells
  • The mechanism of glycolytic oscillations in yeast extracts
  • Biochemical properties derived from Hopf dynamics
  • On the use of sensitivity analysis
  • Cell synchronization
  • Materials and methods
  • Modified metabolic control analysis of limit-cycle oscillations
  • Modified metabolic control analysis at supercritical Hopf bifurcations
  • Construction of flux-change plots
  • Analysis by means of polar phase plane plots
  • Acknowledgements
  • References