Báo cáo khoa học: NMR investigations of subunit c of the ATP synthase from Propionigenium modestum in chloroform/methanol/water (4 : 4 : 1)

NMR Investigations of Subunit c of the ATP Synthase from Propionigenium Modestum in Chloroform/Methanol/Water (4:4:1)

Tác giả: Ulrich Matthey, Daniel Braun, Peter Dimroth

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Cấu trúc protein, Năng lượng tế bào

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này sử dụng kỹ thuật NMR để khảo sát cấu trúc bậc hai và cấu trúc gấp khúc của tiểu đơn vị c trong phức hợp ATP synthase từ vi khuẩn Propionigenium modestum khi được hòa tan trong hỗn hợp dung môi chloroform/methanol/nước (4:4:1). Kết quả cho thấy, trong môi trường dung môi hữu cơ này, tiểu đơn vị c bao gồm hai đoạn xoắn alpha chính. So sánh với cấu trúc trong các micelle dodecylsulfate, có những điểm khác biệt đáng chú ý về cấu trúc xoắn alpha, bao gồm cả sự rút ngắn của đoạn gián đoạn trong vùng vòng lặp tế bào chất và sự biến mất của điểm đứt gãy xoắn alpha sau gốc glutamate liên kết với ion natri. Cấu trúc gấp khúc của tiểu đơn vị c trong dung môi hữu cơ này cũng khác biệt so với Escherichia coli, khi P. modestum không hình thành cấu trúc kẹp tóc (hairpin) ổn định như ở E. coli. Các phương pháp thực nghiệm bao gồm chuẩn bị mẫu, ghi phổ NMR và phân tích dữ liệu chi tiết được mô tả.

Mục lục chi tiết:

• NMR investigations of subunit c of the ATP synthase from Propionigenium modestum in chloroform/methanol/water (4:4:1)
• Introduction
• Experimental Procedures
• Overproduction and purification of subunit c
• NMR sample preparation
• NMR spectroscopy
• Results
• Stability of P. modestum subunit c in chloroform/methanol/water (4:4:1)
• Resonance assignment
• Conformational constraints
• Chemical shift deviations
• Secondary structure and global fold
• Discussion
• Acknowledgements
• References