Báo cáo khoa học: Evaluation of potential regulatory elements identi®ed as DNase I hypersensitive sites in the CFTR gene

Evaluation of Potential Regulatory Elements Identified as DNase I Hypersensitive Sites in the CFTR Gene

Tên đề tài: Evaluation of potential regulatory elements identified as DNase I hypersensitive sites in the CFTR gene

Tác giả: Marios Phylactides, Rebecca Rowntree, Hugh Nuthall, David Ussery, Ann Wheeler, Ann Harris

Lĩnh vực: Paediatric Molecular Genetics, Institute of Molecular Medicine, Oxford University, UK; Center for Biological Sequence Analysis, Biocentrum DTU, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá các yếu tố điều hòa tiềm năng trong gen CFTR bằng cách xác định các vị trí nhạy cảm với DNase I (DHS). Các nhà nghiên cứu đã đánh giá các DHS trong các intron của gen CFTR để hiểu rõ hơn về vai trò của chúng trong việc điều hòa biểu hiện gen. Kết quả cho thấy một số DHS trong các intron 20 và 21 có khả năng tăng cường hoạt động của promoter CFTR. Ngoài ra, nghiên cứu còn xem xét tính đặc hiệu theo mô loại tế bào của các DHS và ảnh hưởng của các chất hoạt hóa biểu hiện gen CFTR. Dữ liệu thu thập được hỗ trợ mô hình điều hòa biểu hiện gen CFTR, trong đó nhiều yếu tố cùng phối hợp để điều hòa chặt chẽ biểu hiện gen trong cơ thể.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Materials and Methods
• Cell culture
• Transient transfection assays
• DNA structure determination
• DNase I hypersensitivity assays
• Treatment with activators of CFTR transcription
• Results
• Transient transfections
• Structure determination
• Tissue specificity of DHS elements
• Activation of CFTR expression
• Discussion
• Acknowledgements
• References