Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 10 trang
Dung lượng: 250 KB

Giới thiệu nội dung

Escherichia coli cyclophilin B binds a highly distorted form of trans-prolyl peptide isomer

Tác giả: Michiko Konno, Yumi Sano, Kayoko Okudaira, Yoko Kawaguchi, Yoko Yamagishi-Ohmori, Shinya Fushinobu and Hiroshi Matsuzawa

Lĩnh vực: Hóa Sinh, Công nghệ Sinh học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá cách Escherichia coli cyclophilin B (CyPB) tương tác với các peptide có dạng trans-prolyl bị biến dạng. CyPB, một thành viên của họ cyclophilin, đóng vai trò trong quá trình đồng phân hóa peptidyl-prolyl, hỗ trợ quá trình gấp lại của protein. Nghiên cứu đã phân tích cấu trúc tinh thể của hai phức hợp giữa CyPB đột biến (K163T) và các peptide có dạng trans-proline. Kết quả cho thấy các peptide này bị biến dạng đáng kể khi liên kết với CyPB, khác biệt so với các phức hợp đã biết của cyclophilin A với peptide dạng cis-proline. Sự biến dạng này cho phép peptide lấp đầy túi kỵ nước của CyPB, với các liên kết hydro được hình thành để cố định cấu trúc. Nghiên cứu cũng so sánh cơ chế liên kết của CyPB với các peptide dạng trans-prolyl bị biến dạng và CyPA với các peptide dạng cis-prolyl, làm sáng tỏ vai trò tiềm năng của CyPB trong việc ổn định các protein bị biến tính.

Mục lục chi tiết:

  • Escherichia coli cyclophilin B binds a highly distorted form of trans-prolyl peptide isomer
  • Keywords: cyclophilin; isozyme; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; peptide binding; refolding.
  • Introduction
  • Materials and methods
  • Preparation of mutant E. coli CyPB
  • Crystallization, data collection, structure determination and refinement
  • Results
  • Structure of the K163T mutant of E. coli CyPB
  • Short peptides containing a trans-form proline bound to E. coli CyPB
  • Comparison between peptides containing trans-Pro bound to CyPB and the loop containing Gly-trans-Pro of the capsid protein bound to human CyPA
  • Comparison between E. coli CyPB with a peptide of the trans-proline form and E. coli CyPA with a peptide of the cis-proline form
  • Discussion
  • Short peptides with a trans-proline are distorted to come to complex with CyPB
  • Protein Data Bank access codes
  • Acknowledgements
  • References