Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 29 trang
Dung lượng: 394 KB

Giới thiệu nội dung

Dự Đoán Liên Kết Trong Mạng Hỗn Tạp Và Ứng Dụng Trong Dự Đoán Mối Quan Hệ Giữa RNA Không Mã Hóa Và Bệnh

Tác giả: NGUYỄN VĂN TỈNH

Lĩnh vực: Khoa học máy tính

Nội dung tài liệu:

Luận án tập trung vào việc dự đoán liên kết trong mạng thông tin hỗn tạp, đặc biệt là ứng dụng trong việc dự đoán mối quan hệ giữa RNA không mã hóa (ncRNA) và bệnh. Nghiên cứu đề xuất các phương pháp tính toán mới nhằm giải quyết các vấn đề còn tồn tại như tính thưa của dữ liệu, sự mất cân bằng mẫu, và sự phụ thuộc quá nhiều vào các mối quan hệ đã biết. Luận án cũng khám phá việc tích hợp dữ liệu từ nhiều nguồn sinh học khác nhau và áp dụng các phương pháp từ các lĩnh vực liên quan để nâng cao hiệu quả dự đoán. Các phương pháp đề xuất bao gồm việc sử dụng thuật toán lọc cộng tác và tiến trình phân bổ tài nguyên trên đồ thị ba phía.

Mục lục chi tiết:

  • MỞ ĐẦU
  • CHƯƠNG 1. CÁC KIẾN THỨC CƠ BẢN
    • 1.1. Các khái niệm cơ bản
      • 1.1.1. Mạng thông tin hỗn tạp
      • 1.1.2. Các hệ thống sinh học
      • 1.1.3. Các RNAs không mã hóa (ncRNAs)
    • 1.2. Dự đoán liên kết trong các mạng thông tin hỗn tạp
      • 1.2.1. Bài toán dự đoán liên kết
      • 1.2.2. Các phương pháp dự đoán liên kết
      • 1.2.3. Các ứng dụng của dự đoán liên kết trong các hệ thống sinh học
    • 1.3. Các phương pháp tính toán dự đoán quan hệ giữa các RNAs không mã hóa và bệnh
      • 1.3.1. Dự đoán quan hệ ncRNA-bệnh được coi là bài toán dự đoán liên kết
      • 1.3.2. Các tài nguyên dùng để dự đoán quan hệ ncRNA-disease
      • 1.3.3. Tính toán độ tương đồng và xây dựng mạng hỗn tạp
      • 1.3.4. Khảo sát tổng quan các phương pháp tính toán để dự đoán quan hệ ncRNA-disease
    • 1.4. Các hướng nghiên cứu của luận án
    • 1.5. Các phương pháp đánh giá và các đo lường đánh giá hiệu quả dự đoán
    • 1.6. Tóm tắt chương
  • CHƯƠNG 2. DỰ ĐOÁN QUAN HỆ GIỮA CÁC NCRNAS VÀ BỆNH KẾT VỚI LỌC CỘNG TÁC VÀ MỘT TIẾN TRÌNH PHÂN BỔ TÀI NGUYÊN TRÊN ĐỒ THỊ BA PHÍA
    • 2.1. Động lực nghiên cứu
    • 2.2. Các nghiên cứu liên quan chính
      • 2.2.1. Giải thuật lọc cộng tác dựa theo item để dự đoán quan hệ ncRNA-disease.
      • 2.2.2. Phân bổ tài nguyên trên đồ thị 3 phía
    • 2.3. Mô hình được đề xuất