Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Đánh giá đa dạng di truyền và tính gây bệnh của nấm Corynespora cassiicola trên cây cao su (Hevea brasiliensis) ở Việt Nam

Đánh giá đa dạng di truyền và tính gây bệnh của nấm Corynespora cassiicola trên cây cao su (Hevea brasiliensis) ở Việt Nam

Tác giả: Nguyễn Đôn Hiệu

Lĩnh vực: Bảo vệ thực vật

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung đánh giá sự đa dạng di truyền và tính gây bệnh của 76 mẫu nấm *Corynespora cassiicola* (MPL) phân lập từ 16 dòng vô tính cao su (DVT) và 6 mẫu đại diện cho các nhóm di truyền, vùng địa lý khác nhau tại Việt Nam. Kết quả khảo sát đặc điểm hình thái cho thấy sự biến thiên về màu sắc, cấu trúc sợi nấm và tốc độ sinh trưởng. Phân tích trình tự vùng rDNA-ITS đã phân chia 76 MPL thành ba nhóm di truyền. Sử dụng chỉ thị phân tử SRAP, các MPL được phân nhóm thành hai cụm chính, cho thấy mối tương quan với môi trường địa lý hơn là nguồn gốc ký chủ. Việc khuếch đại gen mã hóa độc tố cassiicolin (gen Cas) đã phát hiện hai nhóm di truyền dựa trên sự hiện diện của gen Cas2. Nghiên cứu cũng khảo sát khả năng gây bệnh của các MPL trên hai DVT cao su là RRIV 4 (mẫn cảm) và PB 260 (chống chịu), cho thấy tất cả các mẫu đều có khả năng gây bệnh, với mức độ nghiêm trọng khác nhau tùy thuộc vào DVT và điều kiện thử nghiệm.

Mục lục chi tiết:

• Lời cảm ơn
• Lời cam đoan
• Tóm tắt
• Mục lục
• Danh sách chữ viết tắt
• Danh sách các bảng
• Danh sách các hình
• MỞ ĐẦU
• Tính cấp thiết của đề tài
• Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của đề tài
• Ý nghĩa khoa học
• Ý nghĩa thực tiễn
• Mục tiêu nghiên cứu của đề tài
• Thời gian, đối tượng và phạm vi nghiên cứu
• Thời gian nghiên cứu
• Đối tượng nghiên cứu
• Phạm vi nghiên cứu
• Những đóng góp mới của luận án
• Chương 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• Sơ lược về tình hình sản xuất và vị trí cây cao su ở Việt Nam
• Bệnh rụng lá Corynespora trên cây cao su
• Lịch sử và tác hại của bệnh rụng lá Corynespora tại một số quốc gia trên thế giới.
• Lịch sử và tác hại của bệnh rụng lá Corynespora trên cây cao su ở Việt Nam
• Triệu chứng bệnh rụng lá Corynespora trên cây cao su…
• Đặc điểm của nấm Corynespora cassiicola gây bệnh trên cây cao su và một số cây ký chủ khác.
• Vị trí phân loại và đặc điểm hình thái nấm Corynespora cassiicola……
• Phân bố và ký chủ của nấm Corynespora cassiicola.
• Đặc điểm phát sinh và phát triển của nấm Corynespora cassiicola trên cây cao su
• Đặc điểm sinh lý, sự xâm nhiễm, lây lan và lưu tồn của nấm Corynespora cassiicola
• Nghiên cứu về đa dạng di truyền của nấm Corynespora cassiicola bằng chỉ thị phân tử
• Sự đa dạng di truyền ở mức độ phân tử của nấm Corynespora cassiicola
• Các chỉ thị phân tử được sử dụng trong nghiên cứu đa dạng di truyền nấm Corynespora cassiicola
• Chỉ thị phân tử RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)
• Chỉ thị phân tử RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
• Chỉ thị phân tử ISSR (Inter Simple Sequence Repeat)
• Phân tích trình tự vùng rDNA-ITS
• Chỉ thị phân tử SRAP (Sequence-Related Amplified Polymorphism)
• Độc tố cassiicolin của nấm Corynespora cassiicola
• Vai trò của độc tố cassiicolin
• Cấu trúc và đặc tính của độc tố cassiicolin
• Mối liên hệ giữa cassiicolin, tính gây bệnh của nấm Corynespora cassiicola và tính kháng của ký chủ
• Nghiên cứu về đa dạng di truyền gen mã hóa độc tố cassiicolin (gen Cas) của nấm Corynespora cassiicola
• Nghiên cứu về tính gây bệnh của nấm Corynespora cassiicola
• Khái lược về tương tác ký sinh – ký chủ trong bệnh cây
• Thuyết “gen for gen”.
• Tính kháng của ký chủ
• Phản ứng siêu nhạy cảm (HR: hypersensitivity response)
• Chương 2. NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• Nội dung nghiên cứu.
• Thời gian và địa điểm nghiên cứu
• Vật liệu nghiên cứu
• Phương pháp nghiên cứu
• Thu thập mẫu bệnh và phân lập nấm
• Khảo sát đặc điểm hình thái nấm Corynespora cassiicola
• Phân tích đa dạng di truyền nấm Corynespora cassiicola
• Ly trích DNA nấm Corynespora cassiicola.
• Khuếch đại vùng rDNA-ITS bằng kỹ thuật PCR
• Khuếch đại vùng ORFs bằng phản ứng PCR-SRAP
• Phản ứng PCR nhận diện gen Cas
• Khảo sát tính gây bệnh của 76 MPL nấm Corynespora cassiicola trên DVT cao su RRIV 4 (mẫn cảm bệnh) và PB 260 (chống chịu bệnh).
• Đánh giá tính gây bệnh của 6 MPL nấm Corynespora cassiicola đại diện cho các phân nhóm di truyền và vùng địa lý khác nhau trên 12 DVT cao su
• Điều kiện phòng thí nghiệm
• Điều kiện nhà lưới
• Chương 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• Đặc điểm hình thái của nấm Corynespora cassiicola phân lập từ cây cao su
• Đặc điểm hình thái tản nấm Corynespora cassiicola
• Đặc điểm hình thái bào tử nấm Corynespora cassiicola
• Đa dạng di truyền của nấm Corynespora cassiicola phân lập từ cây cao su
• Nhận diện và phân tích mối quan hệ di truyền của các MPL nấm Corynespora cassiicola dựa trên trình tự vùng rDNA-ITS
• Phân tích mối quan hệ di truyền của các MPL nấm Corynespora cassiicola dựa trên chỉ thị phân tử SRAP
• Xác định sự hiện diện của gen Cas trên các MPL nấm Corynespora cassiicola
• Khảo sát tính gây bệnh của 76 MPL nấm Corynespora cassiicola trên DVT cao su RRIV 4 (mẫn cảm bệnh) và PB 260 (chống chịu bệnh).
• Đánh giá tính gây bệnh của 6 MPL nấm Corynespora cassiicola đại diện cho các phân nhóm di truyền và vùng địa lý khác nhau trên 12 DVT cao su
• Điều kiện phòng thí nghiệm
• Điều kiện nhà lưới
• CHƯƠNG 4. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ
• Kết luận
• Đề nghị
• DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH NGHIÊN CỨU CÓ LIÊN QUAN ĐÃ CÔNG BỐ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC