Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: 288 KB

Giới thiệu nội dung

Crystal structures of a bacterial 6-phosphogluconate dehydrogenase reveal aspects of specificity, mechanism and mode of inhibition by analogues of high-energy reaction intermediates

Tác giả: Ramasubramanian Sundaramoorthy, Jorge Iulek, Michael P. Barrett, Olivier Bidet, Gian Filippo Ruda, Ian H. Gilbert, William N. Hunter

Lĩnh vực: Hóa sinh và Vi sinh vật học phân tử, Y sinh và Khoa học đời sống, Dược học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể của enzyme 6-phosphogluconate dehydrogenase (L/PDH) tái tổ hợp từ vi khuẩn Lactococcus lactis. Các cấu trúc này được xác định trong phức hợp với cơ chất, cofactor, sản phẩm và các chất ức chế, bao gồm cả các dẫn xuất của các chất trung gian phản ứng năng lượng cao. Phân tích so sánh với các enzyme tương tự từ các loài khác cho thấy sự bảo tồn cao của các gốc hoạt động và tương tác với cofactor, cũng như sản phẩm ribulose 5-phosphate. Tuy nhiên, có những khác biệt trong cấu hình của cơ chất 6-phosphogluconate, có thể phản ánh các trạng thái khác nhau trong quá trình xúc tác. Nghiên cứu cũng chỉ ra rằng chất ức chế 4-phospho-D-erythronohydroxamic acid (PEX) thực sự mô phỏng trạng thái trung gian năng lượng cao mà nó được thiết kế để ức chế. Ngoài ra, một sản phẩm phụ của quá trình tổng hợp PEX, 4-phospho-D-erythronamide (PEA), cũng được xác định có khả năng liên kết tương tự. L/PDH giờ đây có thể được sử dụng làm hệ thống mô hình cho việc thiết kế chất ức chế dựa trên cấu trúc nhằm vào các enzyme tương tự ở các loài khác, đặc biệt là ký sinh trùng.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả và Thảo luận
  • Phân tích cấu trúc và chất lượng mô hình
  • Cấu trúc tinh thể của các phức hợp 6-phosphogluconate dehydrogenase ligand
  • Cấu trúc của L/PDH và so sánh với TbPDH và OaPDH
  • Vị trí liên kết cofactor
  • Cơ chế hoạt động và cơ chế xúc tác
  • Sự ức chế bởi PEX/PEA
  • Quy trình thực nghiệm
  • Tinh sạch, kết tinh, thu thập và xử lý dữ liệu
  • Xác định và tinh chỉnh cấu trúc
  • Lời cảm ơn
  • Tài liệu tham khảo