Báo cáo khoa học: Critical roles of Asp40 at the haem proximal side of haem-regulated phosphodiesterase from Escherichia coli in redox potential, auto-oxidation and catalytic control

Critical Roles Of Asp40 At The Haem Proximal Side Of Haem-Regulated Phosphodiesterase From Escherichia Coli In Redox Potential, Auto-Oxidation And Catalytic Control

Tác giả: Miki Watanabe, Hirofumi Kurokawa, Tokiko Yoshimura-Suzuki, Ikuko Sagami, and Toru Shimizu

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Sinh học phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào vai trò của Asp40 trong enzyme haem-regulated phosphodiesterase (Ec DOS) từ Escherichia coli. Enzyme này bao gồm hai miền chức năng: một miền cảm biến haem ở đầu N và một miền xúc tác PDE ở đầu C. Trạng thái oxy hóa của haem sắt điều chỉnh hoạt động xúc tác của miền PDE. Các nhà nghiên cứu đã tạo ra các biến thể đột biến của Asp40, một axit amin tạo liên kết hydro với His77 (ligand trục gần) thông qua hai phân tử nước và một cầu muối với Arg85 trên bề mặt protein. Các đột biến Asp40 đã làm tăng đáng kể thế oxy hóa khử của haem và tốc độ tự oxy hóa. Quan trọng hơn, hoạt động xúc tác của enzyme đã bị mất hoàn toàn ở các biến thể đột biến này. Nghiên cứu cho thấy Asp40 đóng vai trò quan trọng trong cấu trúc điện tử của haem sắt và kiểm soát xúc tác phụ thuộc vào oxy hóa khử, làm sáng tỏ cơ chế truyền tín hiệu của enzyme.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Materials and Methods
• Results
• Optical absorption spectra
• Cyanide binding
• Redox potential
• Auto-oxidation rates
• PDE activity
• Discussion
• Acknowledgements
• References