Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 13 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

The Transcriptome of the Colonial Marine Hydroid Hydractinia echinata

Tác giả: Jorge Soza-Ried, Agnes Hotz-Wagenblatt, Karl-Heinz Glatting, Coral del Val, Kurt Fellenberg, Hans R. Bode, Uri Frank, Jörg D. Hoheisel, and Marcus Frohme

Lĩnh vực: Sinh học phân tử, Di truyền học, Phân tích bộ gen

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào việc phân tích bộ transcriptome của thủy tức biển dạng quần lạc Hydractinia echinata. Mặc dù các loài thuộc ngành Cnidaria được xem là đơn giản về hình thái, các dự án giải mã bộ gen gần đây đã cho thấy sự phức tạp cao ở cấp độ gen. Nghiên cứu này thực hiện một dự án tag trình tự biểu hiện (EST) trên Hydractinia echinata để góp phần làm phong phú thêm dữ liệu về ngành này. Sau khi giải trình tự ngẫu nhiên gần 9000 dòng gen, việc phân tích EST đã hé lộ sự đa dạng phong phú về thành phần gen. Các trình tự Hydractinia cho thấy mức độ tương đồng cao hơn với động vật có xương sống so với động vật không xương sống thuộc nhóm ecdysozoan. Một số lượng đáng kể các trình tự chưa từng được mô tả ở động vật đa bào, cho thấy đây có thể là những đột phá của ngành Cnidaria hoặc các gen cổ xưa đã bị mất trong bộ gen của động vật hai lá mầm phân tích cho đến nay. Một cơ sở dữ liệu đã được tạo ra để lưu trữ tất cả thông tin thu thập được.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Tạo các EST của Hydractinia echinata
  • Chú giải chức năng EST
  • Đặc điểm của transcriptome Hydractinia
  • Các trình tự độc nhất của Hydractinia
  • Cơ sở dữ liệu Hydractinia
  • Thảo luận
  • Vật liệu và phương pháp
  • Nuôi cấy động vật
  • Phân lập RNA
  • Thư viện cDNA
  • Quy trình phân tích trình tự và EST
  • Chú giải và phân tích các trình tự Hydractinia
  • Tài liệu tham khảo