Crystal Structures of Isomaltase from Saccharomyces cerevisiae and in Complex with its Competitive Inhibitor Maltose

Crystal structures of isomaltase from Saccharomyces cerevisiae and in complex with its competitive inhibitor maltose

Tác giả: Keizo Yamamoto, Hideo Miyake, Masami Kusunoki, Shigeyoshi Osaki

Lĩnh vực: Crystal structure; Glycoside hydrolase family 13; Isomaltase; Substrate binding; Substrate specificity

Nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể của enzyme isomaltase từ nấm men Saccharomyces cerevisiae, ở dạng tự do và khi phức hợp với maltose, một chất ức chế cạnh tranh. Cấu trúc được phân tích với độ phân giải cao, cho phép quan sát chi tiết cấu trúc ba chiều của enzyme. Isomaltase bao gồm ba miền, trong đó miền A chứa cấu trúc β/α-barrel đặc trưng của họ glycoside hydrolase gia đình 13. Miền C có cấu trúc độc đáo, ít thấy ở các enzyme cùng họ. Nghiên cứu đã xác định vị trí của maltose trong trung tâm hoạt động, với đầu không khử của glucose được xác định rõ ràng. Một con đường nước trong trung tâm hoạt động được mô tả, có khả năng đóng vai trò như một “cống thoát nước” hỗ trợ quá trình gắn kết cơ chất. So sánh cấu trúc của isomaltase với các enzyme tương tự cho thấy sự khác biệt trong cấu trúc trung tâm hoạt động có thể giải thích sự khác biệt về đặc hiệu cơ chất và độ dài chuỗi. Kết quả nghiên cứu cung cấp cái nhìn sâu sắc về mối quan hệ giữa cấu trúc và chức năng của isomaltase, đặc biệt là cơ chế tương tác với cơ chất và chất ức chế.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Results and Discussion
• Overall structure
• Active site structure
• The role of the water chains in the active site pocket
• Differences in chain length specificity among oligo-1,6-glucosidases
• Experimental procedures
• Crystallization and data collection
• Structure determination and refinement
• References