Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 66 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

Các phương pháp dự đoán và ứng dụng vào bài toán đoán nhận khả năng ức chế gen của siRNA

Tác giả: Nguyễn Bá Quân

Lĩnh vực: Hệ thống thông tin

Nội dung tài liệu:

Luận văn này tập trung vào việc tổng hợp các giải pháp nhằm giải quyết bài toán đoán nhận khả năng ức chế gen của siRNA. Nghiên cứu bao gồm các quy tắc thiết kế siRNA hiệu quả và phương pháp dự đoán khả năng ức chế của siRNA. Đồng thời, luận văn đề xuất và áp dụng thực nghiệm một số phương pháp học máy, so sánh kết quả với các phương pháp đã công bố. Kết quả nghiên cứu cung cấp cái nhìn tổng quan và phương pháp áp dụng phù hợp để xây dựng mô hình dự đoán, hỗ trợ điều chế thuốc.

Mục lục chi tiết:

MỞ ĐẦU

CHƯƠNG 1. GIỚI THIỆU TỔNG QUAN VỀ ĐOẠN NGẮN RNA CÓ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ (siRNA)

  • 1.1. Can thiệp RNA
    • 1.1.1. Các cơ chế, thành phần chính của RNAi
    • 1.1.2. Vai trò của RNAi
    • 1.1.3. Thành phần của RNAi
    • 1.1.4. Nghiên cứu can thiệp RNA
  • 1.2. Nghiên cứu siRNA
    • 1.2.1. Lịch sử nghiên cứu siRNA
    • 1.2.2. Chức năng của siRNA
    • 1.2.3. Ứng dụng siRNA
    • 1.2.4. Những thách thức trong nghiên cứu siRNA
  • 1.3. Kết luận

CHƯƠNG 2. CÁC QUY TẮC THIẾT KẾ siRNA HIỆU QUẢ

  • 2.1 Quy tắc thiết kế siRNA
  • 2.2. Quy tắc thiết kế siRNA hiệu quả trong phương pháp sinh học
  • 2.3. Các quy tắc thiết kế trong cách tiếp cận sinh học tính toán
  • 2.4. Kết luận

CHƯƠNG 3. PHƯƠNG PHÁP DỰ ĐOÁN KHẢ NĂNG ỨC CHẾ CỦA siRNA

  • 3.1. Tổng quan một số phương pháp xây dựng mô hình dự đoán ức chế của siRNA
  • 3.2. Phương pháp máy vecto hỗ trợ (SVM- Support vector machine)
  • 3.3. Phương pháp rừng ngẫu nhiên (Random Forest)
  • 3.4. Sử dụng phương pháp học biểu diễn để nâng cao độ chính xác của các mô hình dự đoán
  • 3.5. Kết luận

CHƯƠNG 4. THỰC NGHIỆM VÀ ĐÁNH GIÁ

  • 4.1. Dữ liệu thực nghiệm và cài đặt
  • 4.2. Thực nghiệm các phương pháp học máy dự đoán khả năng ức chế của siRNA
  • 4.3. Đánh giá thực nghiệm
  • 4.4. Kết luận

CHƯƠNG 5. KẾT LUẬN

  • 5.1. Những vấn đề được giải quyết trong luận văn
  • 5.2. Công việc nghiên cứu trong tương lai

TÀI LIỆU THAM KHẢO