Báo cáo khoa học: Proteomic identification of all plastid-specific ribosomal proteins in higher plant chloroplast 30S ribosomal subunit PSRP-2 (U1A-type domains), PSRP-3a/b (ycf65 homologue) and PSRP-4 (Thx homologue)

Proteomic Identification of All Plastid-Specific Ribosomal Proteins in Higher Plant Chloroplast 30S Ribosomal Subunit

Tác giả: Kenichi Yamaguchi and Alap R. Subramanian

Lĩnh vực: Biochemistry, Molecular Biology

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày chi tiết về việc xác định và đặc trưng hóa tất cả sáu protein ribosome đặc hiệu cho lục lạp (PSRPs) trong tiểu đơn vị 30S của ribosome lục lạp ở thực vật bậc cao. Ba trong số các PSRPs này, PSRP-2, PSRP-3 (dạng α/β) và PSRP-4, đã được đặc trưng hóa toàn diện thông qua phân tích proteomic, bao gồm sắc ký lỏng hiệu năng cao, điện di, xác định trình tự peptide và phân tích khối phổ. Nghiên cứu cũng mô tả quá trình nhân bản và giải trình tự cDNA mã hóa các protein tiền chất của PSRP-2, PSRP-3 và PSRP-4. Kết quả cho thấy PSRP-2 chứa hai miền liên kết RNA, có thể đóng vai trò trong việc điều hòa dịch mã. PSRP-3 là protein trực hệ của một protein giả định (sản phẩm gen ycf65) được báo cáo trước đây ở tảo đỏ, và có thể là một ví dụ về sự chuyển gen từ lục lạp sang nhân trong quá trình tiến hóa lục lạp. PSRP-4 cho thấy sự tương đồng cao với protein ribosome cơ bản nhỏ Thx, và có thể là một ví dụ về sự tiếp nhận gen thông qua chuyển gen ngang trong quá trình hình thành ribosome lục lạp. Tất cả sáu PSRPs đều được mã hóa trong nhân và được tổng hợp dưới dạng protein tiền chất có các peptide dẫn đường để nhập vào lục lạp. Nghiên cứu cũng thảo luận về vai trò tiềm năng của các PSRPs trong điều hòa dịch mã theo ánh sáng và sự tiến hóa của chúng.

Mục lục chi tiết:

• Identification, isolation, N-terminal/internal peptide sequencing and MS of PSRP-2, PSRP-3 and PSRP-4
• CDNA cloning and nucleotide sequencing of the cytoplasmic mRNAs for PSRP-2, PSRP-3 and PSRP-4
• Sequence homology of PSRP-2 to ribonucleoproteins containing two U1A-type RNA-binding domains
• PSRP-3 and the hypothetical chloroplast reading frame (ycf65) protein
• Sequence homology of PSRP-4 with Thermus thermophilus 30S subunit protein Thx and a plant mitochondrial protein
• The six PSRPs of spinach chloro-ribosome are identifiable in other higher plants but not always in lower plants and cyanobacteria
• Regulation of chloroplast protein synthesis and the evolution of PSRPS
• Possible nonribosomal functions for PSRPS