Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: 274 KB

Giới thiệu nội dung

On The Molecular Basis Of The Recognition Of Angiotensin II (All)

Tác giả: Andreas G. Tzakos, Alexandre M. J. J. Bonvin, Anastasios Troganis, Paul Cordopatis, Mario L. Amzel, Ioannis P. Gerothanassis and Nico A. J. van Nuland

Lĩnh vực: Hóa Sinh, Sinh Hóa Cấu Trúc

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc 3D độ phân giải cao của octapeptide angiotensin II (AII) trong dung dịch nước, được xác định bằng phép tính mô phỏng tôi luyện (simulated annealing) dựa trên các ràng buộc dẫn xuất từ phương pháp NMR độ phân giải cao. Cấu trúc được tinh chỉnh cuối cùng trong môi trường nước thực nghiệm. Một nhóm 13 cấu trúc đã được thu được với sai số trung bình bậc hai (RMSD) là 0.73 ± 0.23 Å cho các nguyên tử chính của bộ khung. AII biểu hiện một cấu trúc gấp khúc khá gọn gàng. Việc so sánh cấu trúc AII trong dung dịch nước với cấu trúc tinh thể được tinh chỉnh của phức hợp AII với kháng thể đơn dòng ái lực cao (mAb Fab131) cung cấp thông tin định lượng quan trọng về hai đặc điểm cấu trúc chung: cấu trúc hình chữ U của chuỗi Tyr4-Ile5-His6-Pro7, là epitope miễn dịch nhất của peptide, và một motif dạng vòng lặp Asx với nhóm carboxyl của chuỗi bên aspartate liên kết hydro với nhóm NH của chuỗi chính Arg2. Các dữ liệu này được diễn giải theo cấu hình ‘hạt nhân’ sinh học của hormone trong dung dịch, đòi hỏi sự sắp xếp lại cấu trúc hạn chế để nhận diện và liên kết với thụ thể.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Vật liệu và phương pháp
  • Tổng quan về các ràng buộc và thống kê cấu trúc
  • Cấu trúc NMR độ phân giải cao của AII trong dung dịch nước
  • Tính toán và phân tích cấu trúc
  • So sánh cấu trúc X-ray của AII gắn với mAb Fab131 với cấu trúc dung dịch NMR