Báo cáo khoa học: The C-type lectin-like domain superfamily

The C-type lectin-like domain superfamily

Tác giả: Alex N. Zelensky and Jill E. Gready

Lĩnh vực: Computational Proteomics and Therapy Design Group, John Curtin School of Medical Research, Australian National University, Canberra, Australia, Subdivision: Proteomics

Nội dung tài liệu:

Bài viết này cung cấp một cái nhìn tổng quan về siêu họ protein chứa miền giống C-type lectin (CTLD), một nhóm protein ngoại bào lớn ở Metazoa với nhiều chức năng đa dạng. Nghiên cứu này xem xét cấu trúc, sự tiến hóa, phân bố và chức năng của các protein thuộc siêu họ này, bao gồm cả những protein có khả năng liên kết carbohydrate và những protein không có khả năng này. Bài báo cũng thảo luận về các phương pháp phân loại và tiêu chí để xác định các protein CTLD mới, nhấn mạnh tầm quan trọng của việc hiểu rõ cấu trúc và chức năng của chúng trong nhiều lĩnh vực sinh học.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Introduction
• Abbreviations
• The C-type lectin-like domain superfamily
• The CTLD superfamily
• Term definitions: CTLD, CRD, C-type lectin
• Non Metazoan CTLDs
• The CTLD fold
• Variations of the fold: canonical, compact, long, short
• Secondary structure element numbering
• Ca-binding sites
• Sites 1, 2 and 4 play structural roles
• Ca-binding site 2 is involved in carbohydrate binding
• Other contributions to monosaccharide binding affinity and specificity
• Reliability of Ca²+/carbohydrate-binding prediction
• Groups of vertebrate CTLDcps
• Proteins with Link/PTR domain
• Criteria for classification of novel CTLDcps