Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 15 trang
Dung lượng: 417 KB

Giới thiệu nội dung

Conformation and Mode of Membrane Interaction in Cyclotides: Spatial Structure of Kalata B1 Bound to a Dodecylphosphocholine Micelle

Tác giả: Zakhar O. Shenkarev, Kirill D. Nadezhdin, Vladimir A. Sobol, Alexander G. Sobol, Lars Skjeldal, and Alexander S. Arseniev

Lĩnh vực: Hóa sinh, Sinh học cấu trúc, Hóa dược

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá cấu trúc không gian của cyclotide kalata B1 (KB1) khi liên kết với các mixen dodecylphosphocholine (DPC). Sử dụng phổ NMR, các nhà nghiên cứu đã xác định cách KB1 tương tác với bề mặt mixen, chủ yếu thông qua các vòng kỵ nước. Các nhóm mang điện tích và vị trí liên kết cation kim loại hóa trị hai được tách biệt và tiếp xúc với các nhóm đầu ưa nước của chất hoạt động bề mặt. Cấu trúc không gian của KB1 chỉ thay đổi nhẹ khi gắn vào mixen, duy trì cấu trúc dạng tấm β ba lớp được liên kết bởi một nút cystine. Kết quả cung cấp mô hình tương tác đầu tiên giữa cyclotide và màng, cho thấy cyclotide hoạt động như một peptide kháng khuẩn cationic có khả năng hoạt động trên màng.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả
  • Phụ thuộc pH của các dịch chuyển hóa học trong KB1 gắn mixen
  • Đặc trưng định tính cấu trúc KB1
  • Kết nối liên kết disulfide trong KB1 gắn mixen
  • Cấu trúc không gian của KB1 gắn mixen
  • Vị trí liên kết cation kim loại hóa trị hai trong KB1 gắn mixen
  • Mô hình phức hợp peptide-mixen
  • Thảo luận
  • Mô hình hoạt động trên màng của KB1
  • Cấu hình nút cystine trong cyclotide và các knottin khác
  • Sự khác biệt có thể có trong các phương thức tương tác peptide-màng đối với cyclotide ‘bracelet’ và ‘Möbius’
  • Thủ tục thực nghiệm
  • Chuẩn bị mẫu và phổ NMR
  • Sự gắn kết của KB1 vào mixen DPC
  • Tính toán chỉ định phổ và cấu trúc không gian
  • Mô hình hóa phức hợp KB1/DPC-Mn2+
  • Phân tích cấu hình nút cystine trong knottin