Báo cáo khoa học: Functional dissection of a small anaerobically induced bZIP transcription factor from tomato

Functional dissection of a small anaerobically induced bZIP transcription factor from tomato

Tác giả: Simone Sell and Reinhard Hehl

Lĩnh vực: Institut für Genetik, Technische Universität Braunschweig, Germany

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này mô tả việc phân lập và đặc tính hóa ABZ1, một yếu tố phiên mã nhỏ thuộc họ bZIP được cảm ứng trong điều kiện yếm khí từ cà chua. ABZ1 được xác định là một protein định vị tại nhân, có cấu trúc và trình tự tương đồng với các yếu tố phiên mã bZIP họ S, vốn đóng vai trò trong phản ứng với stress. Nghiên cứu đã làm rõ khả năng liên kết DNA của ABZ1, đặc tính định vị nhân, và các miền tương tác protein-protein. Kết quả cho thấy ABZ1 liên kết với các vị trí đích dạng G-box dưới dạng dimer và có khả năng ức chế biểu hiện gen. Đặc biệt, ABZ1 liên kết với promoter CaMV 35S, một promoter được điều hòa giảm trong điều kiện yếm khí. Các thí nghiệm biểu hiện gen tạm thời chỉ ra rằng sự đồng biểu hiện của ABZ1 làm giảm biểu hiện gen của promoter 35S. Điều này gợi ý rằng ABZ1 có thể đóng vai trò trong việc điều hòa giảm biểu hiện gen dưới điều kiện yếm khí.

Mục lục chi tiết:

• Materials and methods
• Tomato cDNA library construction and screening
• RNA isolation and Northern blot hybridizations
• Recombinant protein production and purification
• Electrophoretic mobility shift assays and random binding site selection
• Results
• ABZ1 belongs to a family of small bZIP transcription factors and is anaerobically induced in fruits, roots, and leaves
• The basic domain confers nuclear localization of ABZ1
• ABZ1 binding specificity and dimer formation
• ABZ1 binds to the CaMV 35S promoter which is anaerobically down regulated in tobacco and tomato
• ABZ1 down regulates the CaMV 35S promoter in a transient gene expression assay
• Discussion
• Anaerobic gene expression regulation
• Functional dissection of ABZ1
• Acknowledgements
• References