Báo cáo khoa học: Structure of the substrate complex of thymidine kinase from Ureaplasma urealyticum and investigations of possible drug targets for the enzyme

Structure of the substrate complex of thymidine kinase from Ureaplasma urealyticum and investigations of possible drug targets for the enzyme

Tác giả: Urszula Kosinska, Cecilia Carnrot, Staffan Eriksson, Liya Wang, Hans Eklund

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Cấu trúc protein, Dược lý

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc không gian ba chiều của phức hợp enzyme thymidine kinase (Uu-TK) từ Ureaplasma urealyticum với cơ chất deoxythymidine. Ureaplasma urealyticum là một tác nhân gây bệnh ở người, phụ thuộc vào con đường trao đổi chất phụ để tổng hợp tiền chất DNA, làm cho Uu-TK trở thành mục tiêu tiềm năng cho việc phát triển thuốc. Bài báo mô tả chi tiết cách thức cơ chất liên kết với enzyme, bao gồm cả vai trò của một vòng lasso và vị trí của gốc glutamate xúc tác. Ngoài ra, nghiên cứu còn khảo sát hoạt tính của một loạt các chất tương tự nucleoside, đánh giá khả năng ức chế của chúng và so sánh với thymidine kinase của người (hTK1). Kết quả cho thấy sự khác biệt về cấu trúc và động học giữa Uu-TK và hTK1, gợi ý về khả năng phát triển các chất ức chế chọn lọc. Bài báo cũng thảo luận về tiềm năng của Uu-TK như một mục tiêu cho các loại thuốc kháng sinh mới.

Mục lục chi tiết:

• Keywords: bacterial; crystallography; deoxythymidine; nucleoside analogues; thymidine kinase
• Correspondence
• Note
• Structure of the substrate complex of thymidine kinase from Ureaplasma urealyticum and investigations of possible drug targets for the enzyme
• Results and discussion
• Overall structure
• Substrate binding
• Substrate specificity, nucleoside analogues
• Analogues as inhibitors
• Comparison with hTK1
• Experimental procedures
• Materials
• Enzyme assay
• Crystallization, data collection and refinement
• Acknowledgements
• References